Una fuerza descomunal aparece en la bahía de Tokio y resulta ser un enorme monstruo. Por causas desconocidas, un aparatoso accidente en los túneles de abastecimiento de agua de Tokio obliga a que el gobierno tenga que convocar un gabinete de crisis. Inmediatamente después, aparece la enorme criatura que comienza a destruir una ciudad tras otra hasta llegar a la capital. Ese misterioso organismo gigante se llama Godzilla.

El gobierno japonés trabajará contrarreloj para evitar que el monstruo desate el caos y la destrucción. En su desesperación solicitará ayuda externa a países como EE. UU., pero las armas convencionales serán ineficaces.